航空：截止1996年，日本已经有164个机场。随着政府限制的放宽，为争取航线及降低空运价格、活跃地区经济而设立的航空公司等相继出现。国际航线出现了飞机的大型化、高速化和机票低价格化的倾向。
海运：船舶可在内海沿岸航行，水路长约1770公里。主要港口有东京、大阪、名古屋、秋田、尼崎、千叶、八户、函馆、东播磨、姬路、广岛、川崎、绢浦、神户、钏路、水岛等等。
铁路：全国铁路总长4.7万公里，铁路中的新干线是长距离客运的主要交通手段，有东京至大阪间的东海道新干线、大阪至博多间的山阳新干线、大宫至盛冈间的东北新干线、大宫至新泻间的上越新干线和福岛至山形间的山形新干线等等。此外，在日本的主要大城市中，地铁交织如网，遍布各处，较汽车更为迅捷、准时、方便。
公路：高速公路非常发达，以东京至小牧、小牧至西宫、吹田至下关的公路为首，东北纵贯、九州纵贯、北陆中央等都已全线贯通。此外，还有东京内的首都高速、连接各高速公路的外环高速等，每年都有新的高速公路建成。
