大家帮忙，北京人坐火车从香港过境飞去菲律宾的问题

小弟前些天在cebu定了从香港到clark的往返机票，准备和媳妇儿一起去玩儿，我们是纯粹的中旅，所以北京香港段选择了最便宜的火车卧铺~现在问题出来了，请问我们在北京西站中国海关边检的时候是出示港澳通行证出境还是出示带有菲律宾签证的护照外加上香港飞克拉克的往返机票确认单？这两种情况哪种是中国边境检查认可的？另外，还有从菲律宾回香港的时候，在香港上火车时候又出示什么证件呢？
大家帮忙了，谢谢！
对了，本人和我媳妇儿都不是白护照，都有过别国签证，港澳通行证也都曾经用过，希望大家指教一下，出境时候到底用什么证件的问题，谢谢了！