请问关于在美国转机的事宜！

我的行程是这样的，首先7.1由北京飞纽约，然后7.31再从纽约飞回北京，到从纽约下飞机的时候，要去saint louis一趟(不在纽约留宿，直接去SL)，待一周左右，然后再从saint louis返回纽约。

我有几个问题，首先我是找国内的代理定的北京和纽约的往返机票。
那么，纽约和saint louis之间的往返机票，有必要找国内相同的代理定么？自己直接在美国订票网站或者美国相应的航空公司网站上定可以么？
如果是自己在美国网站上定，那么北京到纽约的票和纽约到saint louis的票可能是2个不同航空公司的，这个对转机没什么影响吧？

另外，如果自己定纽约到saint louis的票，要给在纽约的转机留出多少时间比较合适呢？

最后一个问题，不管是找国内代理定的北京和纽约的往返票，还是自己在美国网站上定的NY和SL的往返票，都可以提前在相应航空公司的网站上面check in么？

问题有点多，因为没去过美国，所以对有些情况不是很熟悉，在此请熟悉情况的朋友给我个答复，谢谢大家了!


再补充个问题，如果按照上面的行车，我的入关手续是在纽约的机场办理，还是在SL的机场办理？只要交I94和入关表格就可以了？

想再补充一个问题，如果我自己在网上订NY到SL的票，那么是不是要在北京到NY下飞机后，取完行李，然后去NY到SL的航空公司去换登机牌？如果我事先在其网站上check in了，还用在纽约的机场换NY去SL的登机牌吗？