福永码头转机去台北该用何证出境?

和很多人一样，我也没有办到台湾通行证，可恶。看了很多帖子差不多知道了从罗湖或者直飞香港的转机方式。但由于时间关系，所以我想选择从福永码头坐船去香港机场。

我的疑问是：在福永码头我该用港澳证出境呢？还是用护照？

因为福永去香港机场不会入关，也就是不会用到香港签注了，边境也应该知道这个情况。而去台湾肯定不是出国，边境也不能在护照上盖出境章吧，两难啊！边境会不会因为我没有赴台证不让我出境呢。

谢谢大家了！麻烦了！