急等!持入台证正本,护照和港澳通行证,用什么证件订机票去台北

目前手上已经有入台证正本，护照和港澳通行证，需要经香港中转去台北。

基本的流程已经了解，就是不确定要用护照号还是港澳通行证号预定联程的机票。如果是用护照号预定的话，大陆这边出关的时候用港澳通行证过关会不会被说是证件不符呢，用护照直接去香港又去不了。

或者可不可以上海-香港往返，香港-台北往返分别用通行证和护照预定呢？

焦急等待中，谢谢！