南通居民L签问题

我有南通的朋友想来香港自由行,他已拿了港澳通行证,由于南通不是个人游城市,所以应该要用L签过关,我想请教大家L签是否在深圳办理,然后跟团过关便可?毋须在南通再办手续?另外,一般L签旅行团的办公时间是否在下午六时前?如果飞机误点他应该怎样过关?估计他会在深圳湾或皇岗过关,烦请大家解答,谢谢