从拱北-澳门-香港转机菲律宾-回北京持通行证入澳门用护照入香港这样可以吗

珠海拱北-澳门（持通行证过关1次签注）
澳门-香港转机-菲律宾（持护照签证和机票过关）
菲律宾-北京护照上有菲律宾一次入境签证
在澳门停留2晚 在香港转机请问
这样的行程 我需要从拱北出关再到香港转机吗 还是直接从澳门到香港就可以了
谢谢各位帮解答一下
补充：样走下来会有个问题，
港澳通行证上的章是：拱北出境、澳门入境、澳门出境护照上的章是：香港入境、香港出境、菲律宾入境、菲律宾出境、北京入境
会不会有问题？（这样通行证上少了一个入境的章）                     
                     （护照上少了一个出境的章）