去普吉，香港出境，机票不是联航机票 除了泰国签注还需要签港澳通行证吗？

2月份去普吉， 东航 上海-香港 香港停留3天 亚航 香港-普吉 东航 普吉-上海 打算先在香港玩3天，机票已定，因为不是联航机票，除了泰国签注还需要签港澳通行证吗？ 出境的时候，这种情况有泰国签注和从香港去泰国的机票确认单，上海海关会允许出境到香港吗？还有香港入境会不会有什么问题呢？
 
纠结啊～ 到底要不要同时去签港澳签注呢？上海浦东机场海关会不会放行？